Vedle hlavní soutěže o Zlatý erb v kategoriích nejlepší webové stránky obcí, měst a nejlepší elektronická služba jsou pravidelně udělovány také speciálně zaměřené ceny.

Zvláštní cena ministra pro místní rozvoj

udělená ministrem Radko Martínkem za nejlepší turistickou prezentaci na webových stránkách při soutěži Zlatý erb byla přisouzena Libereckému kraji.

Zvláštní cena ministra vnitra

udělená ministrem Františkem Bublanem za nejlepší bezbariérový přístup na webové stránky při soutěži Zlatý erb patří obci Jiřetín pod Bukovou.

Výběr vítěze této zvláštní ceny zajišťovala Sjednocená organizace nevidomých a slabozrakých ČR, Metodické centrum informatiky. Pro hodnocení přístupnosti v roce 2006 bylo vybráno 25 z 37 kritérií Pravidel pro tvorbu přístupného webu, vydaných MI ČR. Na hodnocení se podíleli tři testeři, z nichž každý hodnotil určitou část kritérií na všech webech. Počty bezbariérových webů stále narůstají (viz graf).

Zvláštní cena společnosti Microsoft

Tuto sponzorskou zvláštní cenu udělili zástupci společnosti Microsoft Česká republika za pozoruhodné využití MS technologií na webech měst a obcí. Výběr byl proveden z finalistů celostátního kola soutěže Zlatý erb. Zvláštní cena společnosti Microsoft byla udělena v kategorii města: Rokycany, v kategorii obce: Velké Žernoseky

Cena veřejnosti

Cena veřejnosti udělená sdružením BMI při soutěži Zlatý erb připadla obci Němčovice.

Zvláštní cena veřejnosti se uděluje na základě počtu zaslaných hlasů uživatelů webových stránek vztažených na jednoho obyvatele obce (podle údajů uvedených na portálu veřejné správy).

Cena odborné poroty

Zvláštní cena odborné poroty soutěže Zlatý erb získal Středočeský kraj.

Zvláštní cena odborné poroty je zpravidla udělována webovým stránkám kraje a je vybírána celostátní porotou.